Dalam upaya peningkatan mutu berkelanjutan, Sekolah Tinggi Teologi Injili Indonesia (STTII) Yogyakarta secara aktif menjalin kerjasama dengan berbagai institusi termasuk Universitas Sanata Dharma (USD). Melalui kerjasama antae institusi tersebut, diharapkan dapat saling meningkatkan kualitas kegiatan tri dharma perguruan tinggi. Sebagai salah satu bentuk implementasi kerjasama antara STTII dengan USD, pihak STTII mengajukan permohonan pendampingan pelaksanaan Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI) di STTII kepada Rektor USD. Kesanggupan USD untuk menyetujui permohonan tersebut merupakan salah satu bentuk kepedulian USD bagi perguruan tinggi lain yang membutuhkan pendampingan USD, untuk itu USD menugaskan Ketua Lembaga Penjaminan Mutu dan Audit Internal (LPMAI) USD yakni Ibu Dr. apt. Yustina Sri Hartini, M.Si untuk melakukan pendampingan.
Kegiatan pendampingan pelaksanaan SPMI pada STTII Yogyakarta dilaksanakan melalui serangkaian kegiatan koordinasi dan diskusi. Kegiatan paparan dan diskusi secara luring diselenggarakan pada hari Senin, 24 Maret 2025 di Ruang Rapat STTII Yogyakarta. Acara tersebut dihadiri oleh pimpinan STTII serta para koordinator dan anggota team SPMI STTII yang berperan penting dalam pengendalian mutu di lingkungan STTII. Dalam sambutannya, Bapak Dr. Sumbut Yermianto, M.Th selaku Ketua STTII menyampaikan harapannya bahwa kegiatan pendampingan tersebut akan mendukung optimalisasi pelaksanaan PPEPP di STTII terutama dalam rangka penyiapan akreditasi prodi-prodi di STTII. Materi kegiatan pendampingan dipaparkan oleh Ibu Dr. apt. Yustina Sri Hartini, M.Si. Pada sesi pertama pendampingan, Ibu Yustina membahas secara komprehensif tentang SPMI dan SPME sesuai dengan Permendikbudristek No. 53 tahun 2023; dilanjutkan sesi kedua berupa diskusi tentang pelaksanaan PPEPP dalam pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat di STTII.
